Il nome Javier ha origini spagnole e basche, derivando dal basco "Etxeberri" che significa "nuova casa". Nel corso del tempo ha subito alcune modifiche fonetiche diventando prima "Etxeberria" e poi "Javier". Il nome è strettamente legato alla figura di San Ignacio de Loyola, fondatore della Compagnia di Gesù, nato nei pressi di un luogo chiamato "Javier", che significa "casa nuova". In onore del santo, il nome Javier divenne molto popolare tra i cattolici e fu scelto come nome di battesimo per molti bambini. Oggi il nome è ancora diffuso in Spagna e nel Basque Country, ma può essere trovato anche in altre nazioni grazie alla diffusione del culto di San Ignacio de Loyola a livello mondiale.