Il nome Jonatha è di origine ebraica e significa "Dono di Dio". È formato dalla parola ebraica "Yonah", che significa "colomba", e dalla parola greca "theos", che significa "dio".
L'origine del nome Jonatha si perde nella notte dei tempi, ma si ritiene che sia stato usato per la prima volta dagli ebrei durante il periodo biblico. Nel corso dei secoli, il nome è stato adottato da diverse culture e ha subito alcune variazioni ortografiche, diventando così Jonathan, Jonah e Jonatha.
Il nome Jonatha è stato portato da molte figure storiche importanti, tra cui Jonathan Swift, lo scrittore irlandese autore delle "Avventure di Gulliver", e Jonathan Edwards, il predicatore americano che ha svolto un ruolo chiave nella Prima grande sveglia religiosa. Tuttavia, non ci sono prove che questi personaggi abbiano influenzato in alcun modo l'origine o la significato del nome Jonatha.
Oggi, il nome Jonatha è ancora portato da molte persone e continua ad essere associato alla positività e alla creatività grazie al suo significato di "Dono di Dio".
In Italia, il nome Jonatha è stato assegnato a otto bambini nel corso dell'anno 2001. In totale, in Italia, ci sono state otto nascite con questo nome dall'inizio del censimento dei nomi fino ad oggi.